А   Б  В  Г  Д  Е  Є  Ж  З  І  Ї  Й  К  Л  М  Н  О  П  Р  С  Т  У  Ф  Х  Ц  Ч  Ш  Щ  Ю  Я 


Приєднання - амінокислота

Приєднання амінокислоти до 3-кінців тРНК, що каталізує аміно-ацил - тРНК - синтетазой, пов'язане з розщепленням АТФ.

Сама по собі реакція приєднання амінокислот до рРНК оборотна.

Обмеження методу: 1) неповне приєднання С-кінці-вої амінокислоти до бензильну групам полімеру може призводити до утворення домішок, наприклад при синтезі Пента-пептиду А1 - А2 - А3 - А4 - А5 може бути утворена ланцюг А2 - А3 - А4 - А5 при реакції другої амінокислоти з залишилася в першій стадії бензильну групою. Ця реакція конкурує зі стадією Б; 2) неповне приєднання N-захищеної амінокислоти до вільної аміногрупи (стадія Б) може привести до утворення скорочених пептидів (наприклад, А1 - А2 - А3) і неправильної послідовності (наприклад, А1 - А2 - А4 - А5); 3) відсутність аналітичних методів визначення домішок, які можуть застосовуватися без відділення пептиду від полімеру. таке визначення може бути дуже марнотратним, вимагати багато часу і саме по собі призводить до розпаду продукту.

Ця послідовність грає істотну роль при приєднанні амінокислоти.

Реакція з N-карбоксиангидридов амінокислот широко застосовується для приєднання відповідних амінокислот до білків.

На першій стадії перетворень амінокислот (каталізують пири-доксалем або спорідненими йому сполуками) як в хімічних, так і ферментативних системах відбувається приєднання амінокислоти до карбонільної групі каталізатора з утворенням основи Шиффа, яке можна виявити за характерним для нього жовтому забарвленню, відповідної другого з двох максимумів поглинання поблизу 330 і 410 нм. Зазвичай вважають, що будова цього проміжного з'єднання відповідає структурі LVI, і в такому вигляді її досі часто призводять. Реакція амінів з З - оксіпірідін-4 - альдегідів приводить до продуктів, які також мають жовте забарвлення, і їх спектр поглинання схожий на спектри сполук піридоксалю з амінокислотами.

Окису можна брати тільки такі, які при нагріванні в водному розчині протягом 3 - 4 годин гидратируются водою в мінімальному ступені, що забезпечує протікання основної реакції приєднання амінокислоти. Метод барієвих солей амінокислот має переваги перед реакцією отримання оксіалкіламінокіслот з ефноров амінокислот і а-окислів. Він більш простий в препаративних відношенні. Виключається стадія приготування ефірів амінокислот.

Він відкрив ключ генетичного коду шляхом розшифровки триплетів підстав, з яких складаються нуклеотидні ланцюга ДНК і РНК. Кожна комбінація кодує приєднання певної амінокислоти до ланцюжку білка. Ниренберг розшифровував невідомі комбінації, синтезуючи ДНК з вбудованою відомої послідовністю нук-леотідов і визначаючи, яка амінокислота в білку змінилася. У 1968 році він був удостоєний Нобелівської премії з фізіології і медицині разом з Робертом У, Холлі і Харом Кораною.

В даний час допускають можливість присутності ковалентних зв'язків між ліпідної і білкової компонентами в ліпопротеїнів. Були висловлені припущення про приєднання амінокислот і пептидів до гліцерофосфоліпіди допомогою фосфамідной і ацілфос-фатной зв'язків.

Криві титрування показали, що в реакцію з ангідридом вступила приблизно третину аминогрупп і що в основному гліцин приєднується у вигляді поліпептиду. Це, очевидно, є першим випадком приєднання вакантних амінокислот або пептидів до нативним білкам з утворенням пептидних зв'язків в таких м'яких умовах, при яких білок не денатурируется.

Синтез М - наприкінці-вого пентапептіда (Н 1 - 5)[2386]був здійснений, виходячи з дипептида Form-L-Leu-D-Dab (Cbo) - OMe (A 1 - 2) шляхом ступеневої приєднання амінокислотних залишків за допомогою азідного методу. На противагу зазвичай застосовується в пептидному синтезі способу приєднання амінокислот з З-кінця в даному випадку ступеневу нарощування пептидного ланцюга здійснювали, починаючи з N-кінцевого залишку. Всі проміжні пептиди, отримані за допомогою карбодіімідного методу, щодо чистоти і виходу поступалися відповідним пептидів, синтезованим азідним методом. Пептиди з вільними карбоксильними групами були отримані як лужним гідролізом відповідних ефірів, так і безпосередньо за допомогою ангідридового методу шляхом конденсації з солями відповідних нижчих вільних пептидів.

Обмеження методу: 1) неповне приєднання С-кінці-вої амінокислоти до бензильну групам полімеру може призводити до утворення домішок, наприклад при синтезі Пента-пептиду А1 - А2 - А3 - А4 - А5 може бути утворена ланцюг А2 - А3 - А4 - А5 при реакції другої амінокислоти з залишилася в першій стадії бензильну групою. Ця реакція конкурує зі стадією Б; 2) неповне приєднання N-захищеної амінокислоти до вільної аміногрупи (стадія Б) може привести до утворення скорочених пептидів (наприклад, А1 - А2 - А3) і неправильної послідовності (наприклад, А1 - А2 - А4 - А5); 3) відсутність аналітичних методів визначення домішок, які можуть застосовуватися без відділення пептиду від полімеру. Таке визначення може бути дуже марнотратним, вимагати багато часу і саме по собі призводить до розпаду продукту.

Експериментальні спостереження з використанням мічених атомів вказують на пряму участь РНК-переносника в синтезі білка. Так, наприклад, неодноразово відзначалася взаємозв'язок між швидкістю приєднання амінокислот до Р - РНК і швидкістю білкового синтезу. Далі було відзначено накопичення комплексів Р - РНК з амінокислотами в разі припинення білкового синтезу, навпаки, при знятті факторів, що гальмують синтез, відбувалося переміщення мічених амінокислот з Р - РНК на білок.

Структура антибіотика пуромицина. Пуромицин перериває синтез білкової ланцюга, імітуючи аміноацил-т РНК і зв'язуючись з рибосомою. організуючою) матриці, яка робить практично утворення неправильної послідовності або побічні реакції.

У висновку слід зазначити, що і інші амінокислоти у вільному вигляді можуть вступати в реакцію з аліфатичними а-окисями; особливо це відноситься до добре розчинним у воді амінокислот і до наявності в аминогруппе двох оксіалкільних залишків. Таким чином, можна вважати, що реакція окису алкіленов з вільними амінокислотами має загальний характер; що ж стосується ангідроглюкози, то в силу несиметричності цієї окису вона гідратіруется раніше, ніж проходить реакція приєднання амінокислоти, і цей метод для неї не застосуємо.

Активована амінокислота прикріплюється до аденозину, розташованому на кінці ланцюга s - PHK. Оскільки для приєднання амінокислоти мононуклеотид на 2 3 -гідроксільном кінці обов'язково повинен бути представлений аденілові залишком, можна стверджувати, що аденін бере участь в процесі Етері-ції. Стереохимические дослідження показали, що між водневим атомом 2 -гідроксільной групи аденозину (але не З - ОН-групи) та N-3 пуринового кільця може виникнути воднева зв'язок. Отже, швидше за все амінокислота прикріплюється до 2 - ОН-групі, а не до З - ОН-групі кінцевого аденозину s - PHK, хоча не можна виключити подальшого її переходу в З - по-ження.

Поліамідоефіри можуть бути отримані різними методами[73], І ЯМР-спектроскопія ефективно використовується як при вивченні процесів синтезу, так і під час вивчення утворюються полімерів. У роботі[74]методом ПМР вивчені побічні реакції, що протікають при синтезі ненасичених поліамідоефіров сополік індексацією Малеї-нового ангідриду, аліфатичних діолів і 11-аміноундекановой кислоти. Встановлено, що поряд з цис-транс-ізомеризації подвійних зв'язків, що каталізує амінокислотою, має місце значна втрата ненасиченості внаслідок приєднання СООН-групи амінокислоти до подвійного зв'язку. Як і при синтезі ненасичених поліефірів (див. Розд. Більш складні білкові молекули були штучно створені після декількох років. Адже для того, щоб синтезувати певну молекулу із заданою амінокислотною послідовністю, потрібно було по одній нанизувати амінокислоти на пептидний ланцюг. У 50 - х роках XX століття це було так само важко здійсненне, як і півстоліття тому, за часів Фішера. Після приєднання амінокислоти до ланцюга необхідно було відокремити вийшов пептид, подовжений на одну ланку, від вихідних речовин і побічних продуктів реакції, що представляло собою досить тяжку і нудну процедуру.

Цей триплет підстав взаємодіє з трьома і тільки з трьома комплементарними підставами (ДКУ, наприклад) мРНК, що знаходяться в контакті з рибосомою. Кожна рибосома пересувається, або ковзає, уздовж ланцюга мРНКтак, що в певні моменти часу один з її триплетів виявляється в тому місці, куди доставляється амінокислота. Тріплет мРНК, що визначає приєднання амінокислоти, таким чином, кодує її і називається кодоном. Для триптофану кодоном служить ДКУ. Звільнившись від своєї тРНК, кожна амінокислота приєднується ферментативним шляхом до зростаючої поліпептидного ланцюга в результаті утворення пептидного зв'язку між її аминогруппой і карбоксильних кінцем зростаючої ланцюга. На кожній рибосоме є, таким чином, дві ділянки зв'язування: один - для зростаючої поліпептидного ланцюга, а інший - для молекул тРНК, що призводять відповідні амінокислоти.

В основі фотосинтетичного перетворення сонячної енергії лежить фотоіндуціруемий перенесення електрона. У цьому процесі роль донора і первинного акцептора електрона відіграють відновлені тетрапір-рольні системи - хлорофіл і феофітин, мають Макроциклічні кон'югованих систему л-електронних хмар. Функцію вторинного акцептора електрона виконує молекула хинона. Порфірин-хінонову діади широко використовуються в дослідженнях фотоіндуціруемого перенесення електрона в якості биомиметических донорно-акцепторних модельних систем. Введення в їх склад амінокислотних заступників може імітувати присутність амінокислотних залишків білкового оточення хромофоров в природних реакційних центрах. Для вивчення впливу приєднаної амінокислоти на фотохімічні властивості пігменту були також отримані ді - і монопроізводние дейтеропорфіріна IX з тими ж амінокислотами. Також були синтезовані амінокислотні похідні заміщеного тетрафенілпорфіріна з метою з'ясування характеру впливу типу заміщення порфіринового макроциклу і місця приєднання амінокислоти на енергетику системи. Методами електронної та флуоресцентної спектроскопії вивчені фотохімічні властивості отриманих модельних систем. Введення амінокислотного заступника практично не впливає на положення максимумів смуг поглинання і флуоресценції, однак, призводить до збільшення їх інтенсивності. Цей ефект залежить від місця приєднання і природи амінокислоти, а також від конформації молекули.